Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RCC1P18754 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RCC1P18754 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RCC1P18754 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RCC1P18754 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RCC1P18754 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCC1P18754 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCC1P18754 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms