Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms