Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms