Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP4P12644 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BMP4P12644 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BMP4P12644 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms