Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms