Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAMP11215 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAMP11215 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms