Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms