Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms