Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms