Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOC3P02656 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOC3P02656 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOC3P02656 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC3P02656 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC3P02656 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms