Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-HP01893 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms