Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms