Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms