Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCNKO75909 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCNKO75909 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCNKO75909 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCNKO75909 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCNKO75909 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms