Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NIPSNAP2O75323 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPSNAP2O75323 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms