Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GRIN3BO60391 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRIN3BO60391 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms