Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK2O60296 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms