Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMM8AO60220 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TIMM8AO60220 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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