Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP9BO43861 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms