Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1O43719 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms