Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF1O43189 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF1O43189 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF1O43189 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF1O43189 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms