Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APAF1O14727 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APAF1O14727 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
APAF1O14727 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APAF1O14727 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms