Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CROCC2H7BZ55 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CROCC2H7BZ55 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CROCC2H7BZ55 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms