Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms