Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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