Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms