Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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USP17L18D6R9N7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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USP17L18D6R9N7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L18D6R9N7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L18D6R9N7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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