Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms