Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL2C9JE40 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms