Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HACD1B0YJ81 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HACD1B0YJ81 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HACD1B0YJ81 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HACD1B0YJ81 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HACD1B0YJ81 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HACD1B0YJ81 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HACD1B0YJ81 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HACD1B0YJ81 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms