Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WASHC1A8K0Z3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms