Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf47A7E2U8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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