Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GOLGA6L9A6NEM1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L9A6NEM1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms