Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms