Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087WWV3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087WWV3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087WWV3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087WWV3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087WWV3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087WWV3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087WWV3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087WWV3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087WWV3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
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