Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A3GALT2U3KPV4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms