Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETBP1Q9Y6X0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SETBP1Q9Y6X0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms