Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A4Q9Y6R1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms