Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms