Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPS28Q9Y2Q9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms