Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM2AQ9Y2K7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms