Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FARSAQ9Y285 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FARSAQ9Y285 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms