Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms