Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK11AQ9UQ88 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK11AQ9UQ88 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK11AQ9UQ88 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK11AQ9UQ88 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK11AQ9UQ88 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms