Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms