Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms