Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
TNIKQ9UKE5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIKQ9UKE5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms