Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCAN3Q9UKA8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCAN3Q9UKA8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms