Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms