Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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RABGEF1Q9UJ41 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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RABGEF1Q9UJ41 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
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RABGEF1Q9UJ41 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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RABGEF1Q9UJ41 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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RABGEF1Q9UJ41 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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RABGEF1Q9UJ41 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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RABGEF1Q9UJ41 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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RABGEF1Q9UJ41 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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